এনজিও ব্যুরো তথ্য মতে দেশে বর্তমানে বৈদেশিক অনুদান নিয়ে কাজ করে এমন দেশি-বিদেশি ২৬২৫ টি এনজিও রয়েছে। এরমধ্যে বিদেশি এনজিও ২৫৯ এবং দেশি ২৩৬৬। এনজিও ব্যুরোর কঠোর নিয়ন্ত্রণ এর মধ্যে রোহিঙ্গা ক্যাম্পে নয়টি খাতে কাজ করছে দেশী বিদেশী শতাধিক এনজিও। খাতগুলো হল খাদ্য, সেনিটেশন, বাথরুম, নলকূপ স্থাপন, আশ্রয় কেন্দ্র নির্মাণ, কম্বল বা কাপড় বিতরণ, স্বাস্থ্যসেবা ও গৃহস্থালি দ্রব্যাদি বিতরণ।
মৌলবাদী ও সাম্প্রদায়িক সন্ত্রাস তদন্ত কমিশনের তথ্য মতে কক্সবাজারের উখিয়া ও টেকনাফের ৩৪ টি আশ্রয় শিবিরে অবস্থান করছে মিয়ানমারের রাখাইন রাজ্য থেকে পালিয়ে আসা প্রায় ১২ লাখ রোহিঙ্গা। এসব রোহিঙ্গা শিবিরে একশত ছাপ্পান্নটি এনজিও কাজ করছে। এর মধ্যে ৮০ টি আন্তর্জাতিক এনজিও। বাকিগুলো জাতীয় ও স্থানীয় এনজিও। তারা রোহিঙ্গাদের আবাসন, খাদ্য, জ্বালানি, স্বাস্থ্য, শিক্ষা ও অবকাঠামোগত উন্নয়নে কাজ করছে। বিগত বিএনপি-জামায়াত জোট সরকারের আমলে ৪৭৩ স্থানীয় ও ২৫ টি বিদেশী এনজিওকে এনজিও ব্যুরো তালিকাভুক্ত করা হয়েছে। তখনকার জোট সরকারের সমাজকল্যাণমন্ত্রী ছিলেন জামায়াতে ইসলামীর সেক্রেটারি জেনারেল যুদ্ধাপরাধী আলী আহসান মুজাহিদ।
২০২১ সালের ২০ জুন দৈনিক সমকালের এক প্রতিবেদনে বলা হয়েছে শরণার্থী ত্রাণ ও প্রত্যাবাসন কমিশনার কার্যালয় এর তথ্য অনুযায়ী বর্তমানে ইউএন আন্তর্জাতিক, জাতীয়, স্থানীয়সহ মোট ১৫৬ টি বেসরকারি সংস্থা কাজ করে। এরমধ্যে নয়টি ইউএন, ছাপ্পান্নটি আন্তর্জাতিক সংস্থার এনজিও। বাকিগুলো জাতীয় স্থানীয় বেসরকারি সংস্থা। ২০১৯ সালের তথ্য অনুযায়ী টেকনাফ ও উখিয়ায় রোহিঙ্গা আশ্রয় শিবিরে জাতীয়-আন্তর্জাতিকসহ মোট ১৪৬ টি বেসরকারি উন্নয়ন সংস্থা কাজ করেছিল টেকনাফে।
বিভিন্ন অভিযোগের ভিত্তিতে রোহিঙ্গা ক্যাম্প থেকে ৪১টি বেসরকারি সংস্থাকে প্রত্যাহার করা হয়েছে। মিয়ানমার থেকে নির্যাতনের শিকার হয়ে রোহিঙ্গারা বাংলাদেশে আশ্রয় নেওয়া থেকে সর্বমোট ১৫৬ টি এনজিও ক্যাম্পগুলোতে কার্যক্রম চালিয়েছে। গোয়েন্দা সংস্থার প্রতিবেদনের ভিত্তিতে ২০১৮ সালের ১৭ আগস্ট স্বরাষ্ট্র মন্ত্রণালয় থেকে পাঠানো তালিকা ধরে কক্সবাজারের রোহিঙ্গা ক্যাম্পে ৪১ এনজিও কার্যক্রম নিষিদ্ধ করেছে এনজিও বিষয়ক ব্যুরো।
রোহিঙ্গা শরণার্থী ক্যাম্পে নিষিদ্ধঘোষিত এনজিও: ২০১৭ সালের ২৫ আগস্ট রোহিঙ্গা সংকট শুরুর পর নানা অভিযোগে নিষিদ্ধঘোষিত এনজিওগুলোর মধ্যে রয়েছে ইসলামিক রিলিফ world-wide,
ইসলামিক এইড,
মুসলিম এইড ইউকে,
এ্যাকশন এগইনস্ট হাঙ্গার
মেদসা সঁ ফ্রতিয়ে ( এম এস এফ)
স্মল কাইনেজ বাংলাদেশ
বাংলাদেশ চাষী কল্যাণ সমিতি ও নমিজান আফতাবী
ফ্রেন্ডশিপ
এনজিও ফোরাম ফর পাবলিক হেলথ
আল মারকাজুল ইসলামী বাংলাদেশ
ঢাকা আহসানিয়া মিশন
গ্রামীণ কল্যাণ
অগ্রযাত্রা
নেটওয়ার্ক ফর ইউনিভার্সাল সার্ভিসেস এন্ড রুরাল আদ্ভান্সমেন্ট
আল্লামা আবুল খায়ের ফাউন্ডেশন
ঘরনী
ইউনাইটেড সোসাল এডভান্সমেন্ট
পালস
মুক্তি
বুরো বাংলাদেশ
এসএআর
আসিয়াব
এস সি এল এ বি
এস ডব্লিউ এ বি
ন্যাকম
এফ ডি এস আর
জমজম বাংলাদেশ
আমান
ওব্যাট হেল্পার
হেল্প কক্সবাজার
শাহবাগ জামিয়া মাদানিয়া কাসেমুল উলুম অরফানেজ
ডেভলপমেন্ট ইনস্টিটিউট ফর সোশ্যাল এন্ড হিউম্যান অ্যাফেয়ার্স
লির্ডাস
লোকাল এডুকেশন এন্ড ইকোনমিক ডেভেলপমেন্ট অর্গানাইজেশন
অ্যাসোসিয়েশন অফ জোনাল অ্যাপ্রচ ডেভলপমেন্ট
হিউম্যান এইড এন্ড রিলিফ অর্গানাইজেশন
বাংলাদেশ খেলাফত যুব মজলিস
হোপ ফৌন্ডেশন
ক্যাপ আনামুর
টেকনিক্যাল অ্যাসিস্ট্যান্ট ইনকর্পোরেশন
গরীব এন্ড এতিম ট্রাস্ট ফাউন্ডেশনসহ ৪১ টি এনজিও।